Če je ena izmed največjih prednosti varčevanja v zlatu možnost njegovega shranjevanja doma in da nam je na dosegu roke ob vsakem času, pa shranjevanje zlata tudi predstavlja določene težave in dodatne stroške. Veliko vrednost predstavlja že ena unča zlata, zato je za shranjevanje večjih količin zlata potreben dober sef, ki pa ni poceni. Poleg tega pa shranjevanje zlata doma lahko ogrozi celo našo osebno varnost. Čim nepridipravi izvejo ali samo pomislijo, da doma hranimo zlato, smo namreč zelo izpostavljeni nevarnosti ropa.

V primeru, da zaradi osebne varnosti zlata ne želimo shranjevati doma in želimo vseeno varčevati v zlatu, ga lahko shranimo v sefu v banki ali pa varčujemo v obliki zlatih certifikatov ali zlatih računov. Toda tudi naštete možnosti varčevanja v zlatu imajo svoje pomanjkljivosti. Če shranjujemo zlato v sef v banki, imamo lahko resne težave pri njegovem dviganju ob eventualnih težkih časih, medtem ko verjetno ni potrebno posebej poudarjati z dokazovanjem količin zlata v sefu, ki bi jih imeli ob eventualnem bančnem ropu. Zlati certifikati in zlati računi sta sicer danes popolnoma zanesljivi obliki naložbe v zlato, vendar pa obstaja bojazen, da ob morebitni globoki finančni krizi lahko postaneta prav tako nezanesljiva kot vrednosti papirji.